El Litoral La variante Delta del coronavirus ya se convirtió en la mutación dominante en muchos países. A fines de 2020 fue detectada en India y desde principios de marzo de 2021 incrementó su circulación asociada a una dramática segunda ola en aquel país, desde donde se dispersó principalmente a Reino Unido y luego a otros países. Con el objetivo de profundizar el estudio de casos asociados con variante Delta se realizó la secuenciación y análisis evolutivos del genoma completo. Para comprender más sobre el tema, El Litoral dialogó con Ariel Amadío, investigador de INTA-Conicet que estudia las mutaciones del virus.

-¿En qué consiste el proceso?

-Lo que hacemos es una reacción de secuenciación, es decir que se trata de determinar la composición genética completa del virus, todos los nucleótidos que hacen a su genoma. El virus tiene 30 mil letras que pueden ser cuatro letras A, T, G o C, esos son los componentes del ADN que todos los seres vivos tenemos. En el caso del genoma humano, es de 3 mil millones de letras. Secuenciamos todo su genoma en pequeños pedacitos que se superponen entre sí y los amplificamos con una reacción que se llama PCR, que es la misma que se utiliza para su diagnóstico, pero nosotros amplificamos todas las regiones del virus. A eso lo pasamos por un secuenciador automático que va a determinar nuevas secuencias, y después reconstruimos el genoma entero del virus, esas 30 mil letras nos permite compararlo y asignarlo como perteneciente a un linaje u otro.

– ¿Todas las muestras se pueden analizar?

-Las muestras para poder secuenciarlas tienen que cumplir ciertas características, no todas son factibles de ser analizadas, tiene que tener una carga viral mínima; por lo tanto hacemos una selección en función de las características de las muestras para saber si vamos a poder secuenciar el genoma completo. Por otro lado, la provincia está haciendo un tamizaje por tipificación de variantes, esto nos permite determinar la presencia de una mutación característica de las variantes.

-¿Han recibido muchas muestras para analizar?

– En cuanto a la variante Delta son muy pocas las muestras que hemos analizado, fueron no más de 10 ó 12 muestras de toda la provincia.

-¿Hay nuevas variantes circulando en la provincia?

En la Provincia sigue siendo la variante Gamma, también conocida como Manaos, la que ocupa la mayor proporción de casos; también vemos algunos casos, aunque en una proposición un poco más baja, de una variante que se llama Lambda, es muy característica de Latinoamérica.

De la información brindada por el profesional se puede concluir que por el momento los casos de Delta en la provincia de Santa Fe siguen siendo bajos y no se detectaron mutaciones de ninguna de las variantes que circulan por la provincia o en el país. Por otro lado, en estos momentos los casos detectados de Covid-19 corresponden a las variantes Gama, Delta y Lambda.

La variante Delta detectada por primera vez en India sigue siendo la más preocupante. Está afectando a las poblaciones no vacunadas en muchos países y ha demostrado ser capaz de infectar a una mayor proporción de personas vacunadas que sus predecesores. La OMS clasifica a Delta como una variante de preocupación, lo que significa que se ha demostrado que es capaz de aumentar la transmisibilidad, causar una enfermedad más grave o reducir el beneficio de las vacunas y los tratamientos. Según Shane Crotty, virólogo del Instituto La Jolla de Inmunología en San Diego, la “superpotencia” de Delta es su transmisibilidad. Los investigadores chinos encontraron que las personas infectadas con Delta portan 1.260 veces más virus en la nariz en comparación con la versión original del coronavirus. Algunas investigaciones estadounidenses sugieren que la carga viral en las personas vacunadas que se infectan con Delta está a la par de las que no están vacunadas, pero se necesita más investigación. Si bien el coronavirus original tardó hasta siete días en causar síntomas, Delta puede causar síntomas de dos a tres días más rápido, lo que le da al sistema inmunológico menos tiempo para responder y montar una defensa.

Lambda La variante Lambda había atraído la atención como una posible nueva amenaza, pero esta versión del coronavirus, identificada por primera vez en Perú en diciembre, parece estar retrocediendo. Aunque los casos relacionados con Lambda aumentaron en julio, los informes de esta variante han disminuido a nivel mundial durante las últimas cuatro semanas, según datos de GISAID, una base de datos que rastrea las variantes del SARS-CoV-2. La OMS clasifica a Lambda como una variante de interés, lo que significa que porta mutaciones sospechosas de causar un cambio en la transmisibilidad o causar una enfermedad más grave, pero aún está bajo investigación. Los estudios de laboratorio muestran que tiene mutaciones que resisten los anticuerpos inducidos por vacunas.

Mu Mu, la variante antes conocida como B.1.621, se identificó por primera vez en Colombia en enero. El 30 de agosto, la OMS lo designó como una variante de interés debido a varias mutaciones preocupantes, y le asignó un nombre de letra griega. Mu porta mutaciones clave, incluidas E484K, N501Y y D614G, que se han relacionado con una mayor transmisibilidad y una protección inmunitaria reducida. Según el Boletín de la OMS publicado la semana pasada, Mu ha causado algunos brotes más grandes en América del Sur y Europa. Si bien el número de secuencias genéticas identificadas como Mu ha caído por debajo del 0,1% a nivel mundial, Mu representa el 39% de las variantes secuenciadas en Colombia y el 13% en Ecuador, lugares donde su prevalencia ha “aumentado constantemente”, informó la OMS. La agencia de salud global dijo que continúa monitoreando a Mu para detectar cambios en América del Sur, especialmente en áreas donde está co-circulando con la variante Delta. Maria van Kerkhove, jefa de la unidad de enfermedades emergentes de la OMS, dijo que la circulación de la variante está disminuyendo a nivel mundial, pero debe ser observada de cerca. En una conferencia de prensa la semana pasada, el asesor médico en jefe de la Casa Blanca, el Dr. Anthony Fauci, dijo que los funcionarios estadounidenses lo están observando, pero hasta ahora Mu no se considera una amenaza inmediata.

¿Más en camino? Vacunar a más personas contra COVID-19 es fundamental, ya que grandes grupos de personas no vacunadas brindan al virus más oportunidades de propagarse y mutar en nuevas variantes. Ese esfuerzo debe intensificarse a nivel internacional para evitar que surjan variantes sin control entre las poblaciones de países pobres donde muy pocas personas han sido vacunadas, dicen los expertos. Aun así, aunque las vacunas actuales previenen enfermedades graves y la muerte, no bloquean la infección. El virus aún es capaz de replicarse en la nariz, incluso entre personas vacunadas, que luego pueden transmitir la enfermedad a través de gotitas diminutas en aerosol. Para derrotar al SARS-CoV-2 probablemente se requiera una nueva generación de vacunas que también bloqueen la transmisión, según el Dr. Gregory Poland, un desarrollador de vacunas de la Clínica Mayo. Hasta entonces, dicen Polonia y otros expertos, el mundo sigue siendo vulnerable al aumento de nuevas variantes del coronavirus.